Уважаемые участники, поскольку цель № 22 почти завершена, мы рады представить следующую цель.
https://www.sidock.si/sidock/forum_thread.php?id=285
Большинство из вас проголосовали за гликопротеин вируса Эбола (ГП) (174 из 425 голосов, вау!)
Вирус Эбола — высоковирулентный патоген, вызывающий геморрагическую лихорадку Эбола, тяжелое и часто смертельное заболевание. Ключевым фактором способности вируса инфицировать клетки хозяина и вызывать заболевание является его поверхностный гликопротеин (ГП), что делает его привлекательной целью для разработки противовирусных препаратов.
ГП Эбола — это тримерный белок, состоящий из двух субъединиц на мономер: GP1, отвечающий за связывание с рецептором, и GP2, который опосредует слияние между вирусной и клеточной мембранами хозяина.
Первоначально синтезированный как белок-предшественник, ГП расщепляется протеазами хозяина (фурин, катепсин) на свои функциональные субъединицы, процесс, необходимый для его роли в опосредовании проникновения вируса.
GP облегчает прикрепление вируса к поверхности клетки-хозяина, за которым следуют конформационные изменения, которые обеспечивают слияние мембран, позволяя вирусу проникать в клетку-хозяина (к эндосомальному рецептору Ниманна-Пика C1 (NPC1) хозяина или через прямое связывание с мембраной; Vaknin et al.; ACS Infect. Dis. 2024, 10, 5, 1590–1601). Нацеливание на GP для разработки лекарств выгодно из-за его важной роли в вирусной инфекции, его высококонсервативной структуры среди различных штаммов вируса Эбола и наличия специфических полостей связывания, которые могут вмещать ингибиторы малых молекул.
Структурные исследования с использованием таких методов, как рентгеновская кристаллография, идентифицировали эти полости связывания и выяснили конформацию GP как в свободном, так и в ингибированном состоянии. Эти идеи позволяют разрабатывать препараты, которые могут специфически связываться с GP и ингибировать его, стабилизируя его в его предслиятельной конформации или препятствуя его расщеплению, тем самым предотвращая необходимые конформационные изменения для слияния мембран. Мы будем использовать структуры высокого разрешения для проведения экспериментов по виртуальному скринингу в сочетании с моделированием молекулярной динамики, чтобы в конечном итоге идентифицировать потенциальные ингибиторы/модуляторы GP.
Перспективные соединения, идентифицированные с помощью этих вычислительных методов, как мы надеемся, пройдут дальнейшую проверку с использованием биохимических анализов, анализов проникновения псевдовирусов и структурного анализа для подтверждения их ингибирующей активности.
Нацеливание на GP обеспечивает специфичность, поскольку сводит к минимуму нецелевые эффекты на клетки-хозяева и снижает вероятность развития резистентности.
Более того, из-за консервативной природы GP препараты, нацеленные на него, могут быть эффективны против множества штаммов и вариантов вируса Эбола. Мы надеемся, что наши вычисления внесут вклад в борьбу с Эболой!
19 июня 2024 года, обобщенный поиск простых чисел Ферма PrimeGrid обнаружил мегапростое число:
10913140^524288+1
Простое число состоит из 3 689 913 цифр и войдет в «Самую большую базу данных известных простых чисел», заняв 11-е место среди обобщенных простых чисел Ферма и 81-е место в целом.
https://t5k.org/primes
Открытие было сделано Генрихом Подсадой (PoHeDa) из Германии с использованием NVIDIA GeForce RTX 3070 в 16-ядерном процессоре AMD Ryzen 9 5950X с тактовой частотой 3,40 ГГц и 64 ГБ оперативной памяти под управлением Microsoft Windows 11 Professional x64 Edition. Этому компьютеру потребовалось около 50 минут, чтобы выполнить тест на вероятное простое число (PRP) с использованием Genefer23. Генрих Подсада — член команды SETI. Germany.
PRP был подтвержден 20 июня 2024 года на процессоре AMD Ryzen 9 5950X с тактовой частотой 3,4 ГГц и 128 ГБ ОЗУ под управлением Linux Mint 20.3. Этому компьютеру потребовалось около 15 часов 56 минут, чтобы пройти тест на простоту с использованием LLR.
Более подробную информацию можно найти в официальном объявлении.
https://www.primegrid.com/download/GFN-10913140_524288.pdf
Девиз распределённых вычислений - А мне в свою очередь, очень приятно осознавать, что я могу помогать людям и пускай даже порой я не получу за это денег.
Запустим ламу на домашнем кластере.
Llama 3.1 405B, квантизированная до 4 бит, запущенная на двух макбуках (128 гиг оперативки у каждого). Возможно это с помощью exo - тулы, позволяющей запускать модельку распределённо на нескольких девайсах. Поддерживаются практически любые GPU, телефоны, планшеты, макбуки и почти всё о чём можно подумать.
(https://x.com/ac_crypto/status/1815969489990869369)
Запустить ламу на домашнем кластере (https://github.com/exo-explore/exo)
27 июля 2024 года, 09:18:10 UTC,
функция Primorial Prime Search от PrimeGrid обнаружила Primorial Prime: 4328927#+1
Простое число состоит из 1 878 843 цифр и войдет в «Самую большую базу данных известных простых чисел», заняв 1-е место среди первичных простых чисел и 373-е место в целом.
Открытие было сделано Каем Преслером (Aperture_Science_Innovators) из Антарктиды с использованием процессора Intel(R) Xeon(R) E7-8890 v4 @ 2,20 ГГц с 256 ГБ оперативной памяти и Linux Mint 21.1.
http://www.primegrid.com/show_user.php?userid=1654901
http://www.primegrid.com/team_display.php?teamid=1710
Этому компьютеру потребовалось около 6 часов 53 минут, чтобы выполнить тест на вероятное простое число (PRP) с использованием PRST.
Кай Преслер — член команды [H]ard|OCP.
PRP был подтвержден 29 июля 2024 года на процессоре AMD Ryzen 9 7950X3D с тактовой частотой 4,20 ГГц и 128 ГБ ОЗУ под управлением Debian 12.5.
Этому компьютеру потребовалось около 2 дней 3 часов 38 минут для завершения теста на простоту с использованием PGFW с 4 потоками. Более подробную информацию можно найти в официальном объявлении.
https://www.primegrid.com/download/PRS-4328927.pdf